1940年6月11日,华理柱于美国马萨诸塞州的劳伦斯(Lawrence)祝圣美籍玛利诺会士林化东(Raymond Aloysius Lane M.M.)为天主教抚顺代牧区主教。
1946年8月7日,华理柱辞去玛利诺外方传教会总会长的职务。1948年5月,与天主教纽约总主教区总主教史培尔曼枢机(Francis Joseph Cardinal Spellman)访问中国,受到教廷驻华公使黎培里总主教的邀请,赴上海出任“天主教中华全国教务协进委员会”秘书长的职务。1948年8月,华理柱邀请原汉阳教区爱尔兰籍司铎莫克勒赴天津,组建“圣母祈祷会”(圣母军);遂即向全国扩展;1949年1月,华理柱根据教廷传信部的“应变”训令,与黎培里总主教组织全国大修院向境外撤退;1949年7月13日,华理柱转发了教宗庇护十二世关于反对共产主义的通谕;并要求全国各教区及时向上海汇报;同时在全国各教区组织“要理小组”等学习组织,进行反共产主义宣传;龚品梅兼任上海教区主教后,华理柱遂支持龚品梅反对驱逐外籍传教士、自办教会等政策,向全国各教区派遣人员,通令各教区严守梵蒂冈的相关训令。中央政府宣布取缔“天主教中华全国教务协进委员会”和“圣母军”后;华理柱居住于上海教区主教公署,通过上海教区龚品梅主教,阻止圣母军成员向政府登记。
怀念师主教:“童时举杯似圣爵,幕道晋铎喜成真。赴汤易县逢战乱,马李师众八面槽。夜来汽车卸军火,晨时招叫众人见。指说兵器是马师,惊天假案属天祸。逐马判师是无期,兴凯湖中度岁月。为望教人得付洗,不畏事发杀身祸。只为尽职显神通,身处晋煤达九年。车碎乱石身无恙,八零平反冤错案。回乡福传尽牧职,三番五次又进监。至今长达五十年。”