伯多禄元首职权，是说伯多禄为十二宗徒之长，耶稣所立的教会的元首。从《新约》的记述看来，可说伯多禄享有这元首职权，是相当清楚的，今就伯多禄如何获得这元首职权，以及如何执行了他这职权，分述如后：
（一）耶稣立伯多禄为教会的元首：
按玛16:13-20所载：在斐理伯的凯撒勒雅境内，当伯多禄代表宗徒首先承认耶稣是默西亚，永生天主之子后，耶稣给他说：「约纳的儿子西满，你是有福的，因为不是肉和血启示了你，而是我在天之父」。接着又说：「我再给你说：你是伯多禄（盘石）在这盘石上我要建立我的教会，阴间的门，必不能战胜她。我要将天国的钥匙交给你：凡你在地上所束缚的，在天上也要被束缚，凡你在地上所释放的，在天上也要被释放」。耶稣以三个象征的说法，来说明赐给伯多禄为教会元首的职权。
1. 称伯多禄为「盘石」。这句话，在中文以及其他译文（法文则甚确当），不易看出。伯多禄原名西满伯多禄，即希腊文「盘石」之意。按阿剌美语，「盘石」即是「刻法」。这一名字，按若1:42，是耶稣收他为门徒时，已给他起了这名字。是以耶稣从收他为门徒时，已有意立他为教会的元首。在玛16:18，于是就用在收他为门徒时，给他起的富有象征之意的名字来说，你是「刻法」（盘石），在这盘石上我要建立我的教会。盘石的寓意，由耶稣所讲建屋的比喻（玛7:24,25），即可知是指坚固的根基，在以盘石为基础的房屋，不会倒塌，由路22:31,32的记载，可知耶稣如何使伯多禄成为坚固的盘石。
2. 将天国的钥匙交给伯多禄，钥匙，乃象征权柄，在《旧约》里已有类似的说法（见依22:22）。
3. 再以「束缚」与「释放」二字来形容赐与伯多禄的权柄。束缚与释放二字的说法，虽不见于《旧约》，然为当时经师们所惯用的语词，是以为当时的听众，可说一听即瞭解此二字的含意，尤其配以前一象征，钥匙，毫无疑的，使人明瞭耶稣将管理教会的全权交与伯多禄，即将立法、司法和行政大权，交与了伯多禄。
是以与教会分离的誓反教弟兄，对这段经文的含意也十分清楚，无法加以曲解；但他们认为本段经文只见于《玛》，其他《对观福音》只字未提，便以这段经文，非为原文，而是日后罗马教会加入的。不过根据古抄卷，各古译本，以及古代教会的传授，尤其教父们的着述，对玛16:13-20本属原文而非日后由罗马教会加入的，可谓有据可凭（《谷》未记载这段，可以理解，因为他对伯多禄有光荣之事，一概不提。《路》则在22:31,32记载耶稣特别为伯多禄祈求，不但使他，免于丧失信德，并且要他坚固自己的兄弟）。若再证以若21:15-17耶稣三次给他说：「你牧放我的羊群」，则耶稣立伯多禄为教会的元首，可说确是一不可争辩的史实。
（二）伯多禄如何执行了他为教会元首的职权：
如要明瞭伯多禄如何执行了他为教会元首的职权，这一问题，事实上并非太难，只要打开宗，并仔细阅读宗前半部有关伯多禄的记述，即可得到一个相当清楚的答案。
根据《宗》的记述，刚在耶稣升天后，圣神尚未降临前，即由伯多禄提议，应由门徒中另选一人以补犹达斯之缺（1:15-26）。圣神降临后，虽然十二位宗徒都曾向在场的犹太人讲道，但宗一再特别提出伯多禄的名字（2:14,37,38），而且按2:40,41节的记述，圣神降临的那天，三千人受洗，是因听了伯多禄的讲道。阿纳尼雅夫妇犯了欺骗圣神之罪，由伯多禄处以惩罚（5:1-10）。类似的罚也由伯多禄施于西满术士（8:20-23）。伯多禄为第一人收外教人科尔乃略为信徒，并在耶路撒冷犹太信友前陈明他所以如此作，是受了天主特别的启示（11:1-18）。最特出的一点，是伯多禄在耶路撒冷所开的宗徒会议上，好似以他为元首的权威，解决了当时所激辩的问题，应如何对待由外教归信基督的信友（15:7-11）。
唯一可提出似乎反伯多禄元首职权的只有迦2:11-14所谓安提约基雅事件。不过，这一问题，早在第三世纪德都良已说过：「伯多禄的过错是在他的作风，而不是在他的宣讲」（Conversationisfuitvitium,nonpraedicationis.Cfr.DePraescriptioneXXIII）。换言之，充其量，伯多禄的失策是一时的作为不当，毫不涉及教义理论，是以毫不影响他为元首的职权。即近代唯理派的基督徒，也不能以此点来推翻全部《新约》其他确凿以伯多禄为教会元首的证据。
由上述两点，可知伯多禄（当然包括他合法的继承者罗马教宗），实为耶稣所立的教会的元首，而在教会内享有元首职权。
见伯多禄、不误性。